香港浸会大学理学院教学与研究范畴方面表现不凡，目前，开办理论与实践并重的研究生课程，为有志提升专业水平的社会精英奠定良好的学术基础。
课程设计与时并进，切合香港及内地市场需求。理学院于2012学年共开办六个授课式研究生课程，所有课程均设有一年全日制，部分设有两年兼读制，成绩优异者更有机会获得丰厚奖学金。
高级信息系统理学硕士
留学360介绍：因应本地及国内信息技术市场对有关专才的需求日益增加，计算器科学系为有意在相关领域的进修的人士设计了高级信息系统理学硕士课程。由于学系对信息技术市场有深厚认识，并与多间本地科技企业有紧密联系，确保课程内容及所应用的技术符合业界的最新趋势。课程同时为学员提供常用的信息系统软件及工具的实践经验，学员将有机会学习当代最先进的信息系统，成为相关领域的专才。
分析化学理学硕士
浸大的分析化学为全港最强。课程于1992年开办，是香港以至东南亚唯一的同类课程，为有意在分析化学、检测及认证和相关领域进修的人士设计，并因应社会对食物安全检测的要求，增加食物安全检测选修课。定期举办讲座，邀请从事相关范畴的专业人士主讲。收生范围广泛，有不少教师、实验室职员、政府化验所及检测公司职员、化学制品销售员，甚至医生报读。学员不限于化学本科生，也有不少环境、医药、食品背景的人士报读。
环境及公共卫生管理理学硕士
一般教授环境管理的课程，多偏重环境学或工程，少有教授环境与人类健康的联系。此课程则是香港唯一将环境与公共卫生管理知识相结合的相关课程。课程针对现时社会重视食物安全的情况，增加教授食物安全的比重，同时加强职业健康的知识。
绿色科技(能源)理学硕士
随着世界工业化和城市化进程的迅速推进，绿色能源的开发和利用是世界各国面临的一个重大热点问题。绿色科技(能源)理学硕士课程依托浸大物理系多年来的教学科研经验，为相关专业本科毕业生提供进一步深造的平台，使其适应未来内地和香港在绿色能源、低碳经济、环境监测领域以及相关政府职能部门对高级人才的需求。本课程以高级理论知识为基础，通过丰富有趣的专题实验培养学生的动手实践能力。
资讯科技管理理学硕士
课程针对香港信息技术行业朝向高增值的发展方向，让学员掌握先进的信息技术及管理知识，并将这些信息和管理知识融会贯通。课程中的必修科“信息技术论坛”，定期邀请信息技术界的重量级人物作报告，例如介绍银行界中最新的信息技术发展;并与学员分组聚餐，让学员有机会与行内人士交流。
运筹学及商业统计学双硕士
浸大数学系及英国肯特大学(University of Kent)于2007年合办「运筹学及商业统计学双硕士课程」，肯特大学的教师每年都会来香港教授多个科目。学员修毕此课程后，可以同时取得两所院校的硕士学位。课程结合浸大理学院及肯特大学商学院的特色，教授建立模型及数据分析的学问，学员既可学习运筹学及商业统计学的专业知识，也可以体验西方的教学方式，掌握双重优势。
